O que é o tipo de arquivo .TRE?
A extensão de nome de arquivo .tre denota principalmente o tipo de arquivo Maximum Clade Credibility (MCC) Tree (.tre) associado à análise de dados em filogenética. As árvores MCC (.tre) representam os resultados mais prováveis (credíveis) de uma análise de inferência Bayesiana executada contra um dado conjunto de dados filogenéticos. Um arquivo .tre é uma única árvore de CCM. Contém um conjunto estruturado de dados filogenéticos geograficamente referenciados ou indexados, geralmente chamados de árvore R. O arquivo .tre em si é um grande documento de texto que pode ser aberto diretamente em um editor de texto, entretanto, sua representação significativa só é possível com uma ferramenta de análise ou visualização adequada. Geradas por softwares como o BEAST (Bayesian Evolutionary Analysis Sampling Trees), as árvores MCC são usadas para realizar estudos filogeográficos e podem ser plotadas visualmente usando ferramentas dedicadas como o FigTree. Para serem visualizadas no Google Earth, as árvores de CCM (.tre) podem ser convertidas para KML.
Alternativamente, a extensão .tre representa o tipo de arquivo CCS C Compiler Call Tree (.tre), com referência a uma série de ferramentas de geração de código para programação de microcontroladores PIC (Microchip Technology Inc.), comercialmente disponíveis na CCS, Inc. Além do Compilador CCS C autônomo, tais ferramentas incluem o ambiente de desenvolvimento integrado PCW e suas subversões. Um arquivo de árvore de chamadas (.tre) contém uma lista completa de chamadas de funções em um determinado projeto C, juntamente com dados de uso de memória para cada função. Árvores de chamadas (.tre) servem para facilitar a depuração e otimização do código.
Além do acima mencionado, a extensão .tre pode ocorrer em conexão com árvores de diretório de sistemas de arquivos geradas por várias ferramentas de gerenciamento de sistemas de arquivos e salvas como arquivos .tre. Neste contexto, um arquivo .tre é uma lista hierarquicamente estruturada de nomes de arquivos e pastas, representando o conteúdo de um determinado diretório. Embora as árvores de directórios (.tre) possam utilizar vários formatos arbitrários, tais ficheiros são normalmente baseados em texto.
Software para abrir ou converter arquivos TRE
Você pode abrir arquivos TRE com os seguintes programas:
MEGA6 by Center for Evolutionary Medicine and Informatics